1977 İzmir doğumludur. 1998 yılında Ege Üniversitesi psikoloji bölümünden mezun oldu. Yine aynı yıl bir rehabilitasyon merkezinde zihinsel engelli, otizmli, özel öğrenme bozukluğu  ve davranış sorunları olan çocuklarla çalıştı. Beş yıl süre ile bu merkezde eğitimcilik ve idarecilik görevini sürdürmesinin ardından 2003 yılında İzmir Narlıdere’de Özel Mavi Dere Özel Eğitim ve Rehabilitasyon Merkezinin kurulmasına öncülük etti. 

Küçük Adımlar Sertifika programı, otizm ve cinsel gelişim eğitim programı, PEP-3, konuşma bozuklukları eğitim programı, davranış bozuklukları eğitim programı, otistik çocuklarda ritim ve ilişki, acil tıp temel yaşam desteği kursu, tıbbi hipnoz etkinliği gibi alanı ile ilgili pek çok eğitim ve çalışmaya katılmış, bir yıl İzmir Özel Eğitim Kurumları Derneği (İzmir ÖZEK) başkanlığı görevini üstlenmiştir. 

Psikolojinin tıbbi uygulamaları yetki belgesine sahip olan Ebru Aygün, 24 yıldır özel eğitim ve rehabilitasyon alanında psikolog olarak görevine devam etmektedir.